机械厂会计报案，保险柜二十万被盗，但杨震却在现场发现火药痕迹，厂长交代出是朋友罗见军拿来一箱炸药托他保存一夜。
局里前些天通报100公斤炸药被盗不知去向，干警们一直心中不安。杨震迅速赶到罗见军处，起获他盗得的30公斤炸药，确定丢失的是70公斤。
刻不容缓，六组绝不能让炸药在外面响一声。而这些炸药被一个犯罪团伙抢去，准备在火拼中用上，杨震及时赶到，将身绑炸药的团伙首领缉拿。
经过六组连续作战，剩下部分的炸药也在制做加工过程中被堵住，整整一百公斤全部收了回来，六组人却累得都睡了过去……
南方某市刑警队请六组协助，他们缉拿到的一个案犯王辉要戴罪立功，身带一千克毒品来到本市，与另一个贩毒团伙接头。
全都布控好之后，不料王辉却临时改变主意潜逃，季洁将王辉重新捕获，发现王辉有顾虑，他妹妹正在本市上大学，受到犯罪团伙的威胁。
季洁答应保护王辉妹妹的安全，并向上面再次申请加拨一千克毒品，以吊出大鱼。最终将犯罪团伙破获……
重案六组第二部第18集剧情介绍凶手陈风大喊着杀人在街上奔跑，抓捕中丁箭被刺伤，被杀者却是贪污百万公款在逃的通缉要犯。
案件曲折离奇，杨震、丁箭调整思路最终将案件搞得水落石出。
案犯蒋明海多次翻供，将丁箭逼得狼狈不堪，加上歌厅经理的陷害，丁箭被停职审查。
六组干警忍辱负重最终将蒋明海推上法庭，丁箭的冤屈也被洗清。
重案六组第二部第19集剧情介绍出租车女司机被害，在全市引起强烈反响。
六组干警背负承重压力，最终发动起人民战争汪洋大海的力量，将凶犯绳之以法。
王燕杀死公司经理，以正当防卫为由投案自首。
季洁通过法医对死者创口的尸检报告分析出王燕并非真凶，原来王燕被经理强奸，其丈夫又软弱无能，不能为其伸冤，便伙同姘夫将经理杀害。
重案六组第二部第20集剧情介绍近来出现的一个飞车抢劫团伙让季洁和田蕊着实忙得可以。他们一直监视着的海子却没什么动静，据说背后的主使者是他的舅舅朱三，而朱三至今还未露面。
饭馆老板娘红姐的儿子小成也被海子带了进去。杨震和丁箭也接到了一个母女同时被害案，尸体在河边发现。
报案人叫鲁全。其实案件并不复杂，深谙犯罪心理学的杨震终于攻破了鲁全的心理防线。
事实真相浮出水面：姐姐鲁梅对鲁全的生活极尽照顾，但是因为鲁全的不求上进让鲁梅在家里家外都对他不放在眼里，这激起了鲁全对姐姐的怨恨，在姐姐和她的女儿的饭里下了毒药。
鲁全的案件结了，季洁那一组与此同时监听到了海子和朱三的通话。
被郑一民的关心感染的小成找到重案组，希望他们可以阻止海子的行动。
抓捕行动中，郑一民被飞车团伙击伤住进医院，而丁箭跟踪海子，也最终找到了逃跑隐藏的朱三。
两桩案件的完结终于让大家松了一口气。
